corades, а, случайно, не по разным ли директориям лежали у вас задвоившиеся файлы? Тогда - да, двоятся.
А если все свалить в одну папку - тогда прога исправно пропускает дубли, вплоть до того, что не задваивает случайно скаченные сим3паки и пакеджи с одинаковым содержимым.
Так что рекомендую попробовать.
Еще удобно бывает распотрошить дом в сим3паке на пакеджи (когда присутствует кастомный контент) и забросить их в общую папку с контентом для последующей архивации, это позволяет не утяжелять игру за счет отсеивания лишних копий (впрочем, можно теоретически и сам пак с домом закинуть в эту общую папку, по идее и так можно избавляться от лишнего, но таких живых экспериментов я не проводила, так что ручаться не могу
)