[Squirrel]

Mopsja, по-моему когда речь идёт о мозге как об органе, говорится "в мозгЕ". "Врачи провели операцию на мозге".
А если про мозг в значении "ум" - тогда "в мозгУ". "Промелькнула мысль в мозгу".

Так что и тот, и другой варианты верны.